Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Brinp3Q499E0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Brinp3Q499E0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Brinp3Q499E0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Brinp3Q499E0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Brinp3Q499E0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Brinp3Q499E0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Brinp3Q499E0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Brinp3Q499E0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Brinp3Q499E0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Brinp3Q499E0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Brinp3Q499E0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Brinp3Q499E0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Brinp3Q499E0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Brinp3Q499E0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Brinp3Q499E0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Brinp3Q499E0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brinp3Q499E0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brinp3Q499E0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brinp3Q499E0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brinp3Q499E0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brinp3Q499E0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brinp3Q499E0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Brinp3Q499E0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Brinp3Q499E0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Brinp3Q499E0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Brinp3Q499E0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Brinp3Q499E0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Brinp3Q499E0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Brinp3Q499E0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Brinp3Q499E0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Brinp3Q499E0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Brinp3Q499E0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Brinp3Q499E0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Brinp3Q499E0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Brinp3Q499E0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Brinp3Q499E0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Brinp3Q499E0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Brinp3Q499E0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Brinp3Q499E0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Brinp3Q499E0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Brinp3Q499E0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Brinp3Q499E0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Brinp3Q499E0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Brinp3Q499E0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Brinp3Q499E0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Brinp3Q499E0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Brinp3Q499E0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Brinp3Q499E0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Brinp3Q499E0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Brinp3Q499E0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Brinp3Q499E0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Brinp3Q499E0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Brinp3Q499E0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Brinp3Q499E0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Brinp3Q499E0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Brinp3Q499E0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Brinp3Q499E0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Brinp3Q499E0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Brinp3Q499E0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Brinp3Q499E0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Brinp3Q499E0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Brinp3Q499E0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Brinp3Q499E0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Brinp3Q499E0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Brinp3Q499E0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Brinp3Q499E0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Brinp3Q499E0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Brinp3Q499E0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Brinp3Q499E0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Brinp3Q499E0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Brinp3Q499E0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Brinp3Q499E0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Brinp3Q499E0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Brinp3Q499E0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Brinp3Q499E0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Brinp3Q499E0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Brinp3Q499E0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.4 ms