Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm29609Q3UU56 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm29609Q3UU56 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm29609Q3UU56 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm29609Q3UU56 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm29609Q3UU56 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm29609Q3UU56 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm29609Q3UU56 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm29609Q3UU56 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm29609Q3UU56 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm29609Q3UU56 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gm29609Q3UU56 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm29609Q3UU56 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm29609Q3UU56 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm29609Q3UU56 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm29609Q3UU56 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm29609Q3UU56 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm29609Q3UU56 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm29609Q3UU56 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm29609Q3UU56 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm29609Q3UU56 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm29609Q3UU56 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm29609Q3UU56 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm29609Q3UU56 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm29609Q3UU56 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm29609Q3UU56 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm29609Q3UU56 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm29609Q3UU56 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm29609Q3UU56 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm29609Q3UU56 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm29609Q3UU56 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm29609Q3UU56 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm29609Q3UU56 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm29609Q3UU56 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm29609Q3UU56 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm29609Q3UU56 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm29609Q3UU56 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm29609Q3UU56 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm29609Q3UU56 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm29609Q3UU56 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm29609Q3UU56 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm29609Q3UU56 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm29609Q3UU56 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm29609Q3UU56 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm29609Q3UU56 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm29609Q3UU56 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm29609Q3UU56 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29609Q3UU56 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29609Q3UU56 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm29609Q3UU56 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm29609Q3UU56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm29609Q3UU56 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm29609Q3UU56 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm29609Q3UU56 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm29609Q3UU56 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm29609Q3UU56 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm29609Q3UU56 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm29609Q3UU56 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm29609Q3UU56 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm29609Q3UU56 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm29609Q3UU56 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm29609Q3UU56 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm29609Q3UU56 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm29609Q3UU56 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm29609Q3UU56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm29609Q3UU56 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm29609Q3UU56 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm29609Q3UU56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm29609Q3UU56 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm29609Q3UU56 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm29609Q3UU56 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm29609Q3UU56 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm29609Q3UU56 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms