Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cln5Q3UMW8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cln5Q3UMW8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cln5Q3UMW8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln5Q3UMW8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cln5Q3UMW8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln5Q3UMW8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cln5Q3UMW8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln5Q3UMW8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln5Q3UMW8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cln5Q3UMW8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cln5Q3UMW8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cln5Q3UMW8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cln5Q3UMW8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cln5Q3UMW8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cln5Q3UMW8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cln5Q3UMW8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cln5Q3UMW8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cln5Q3UMW8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cln5Q3UMW8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cln5Q3UMW8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cln5Q3UMW8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cln5Q3UMW8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cln5Q3UMW8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln5Q3UMW8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cln5Q3UMW8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cln5Q3UMW8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cln5Q3UMW8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cln5Q3UMW8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln5Q3UMW8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cln5Q3UMW8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cln5Q3UMW8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cln5Q3UMW8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cln5Q3UMW8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln5Q3UMW8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cln5Q3UMW8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cln5Q3UMW8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cln5Q3UMW8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cln5Q3UMW8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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