Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf224Q3UIW8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf224Q3UIW8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf224Q3UIW8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf224Q3UIW8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf224Q3UIW8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf224Q3UIW8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf224Q3UIW8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf224Q3UIW8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf224Q3UIW8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf224Q3UIW8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf224Q3UIW8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf224Q3UIW8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf224Q3UIW8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf224Q3UIW8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf224Q3UIW8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf224Q3UIW8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf224Q3UIW8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf224Q3UIW8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf224Q3UIW8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf224Q3UIW8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf224Q3UIW8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf224Q3UIW8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf224Q3UIW8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf224Q3UIW8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf224Q3UIW8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf224Q3UIW8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf224Q3UIW8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf224Q3UIW8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf224Q3UIW8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf224Q3UIW8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf224Q3UIW8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf224Q3UIW8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf224Q3UIW8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf224Q3UIW8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf224Q3UIW8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf224Q3UIW8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf224Q3UIW8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf224Q3UIW8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf224Q3UIW8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf224Q3UIW8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf224Q3UIW8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf224Q3UIW8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf224Q3UIW8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf224Q3UIW8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf224Q3UIW8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf224Q3UIW8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf224Q3UIW8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf224Q3UIW8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf224Q3UIW8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf224Q3UIW8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf224Q3UIW8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf224Q3UIW8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf224Q3UIW8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf224Q3UIW8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf224Q3UIW8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf224Q3UIW8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf224Q3UIW8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf224Q3UIW8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf224Q3UIW8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf224Q3UIW8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf224Q3UIW8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf224Q3UIW8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf224Q3UIW8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf224Q3UIW8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf224Q3UIW8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf224Q3UIW8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf224Q3UIW8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf224Q3UIW8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf224Q3UIW8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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