Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA16

Spc25, Kinetochore protein Spc25, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc25Q3UA16 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spc25Q3UA16 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spc25Q3UA16 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spc25Q3UA16 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spc25Q3UA16 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spc25Q3UA16 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spc25Q3UA16 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spc25Q3UA16 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spc25Q3UA16 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spc25Q3UA16 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spc25Q3UA16 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spc25Q3UA16 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spc25Q3UA16 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spc25Q3UA16 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Spc25Q3UA16 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spc25Q3UA16 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spc25Q3UA16 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spc25Q3UA16 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spc25Q3UA16 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spc25Q3UA16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spc25Q3UA16 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spc25Q3UA16 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spc25Q3UA16 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spc25Q3UA16 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spc25Q3UA16 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spc25Q3UA16 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spc25Q3UA16 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spc25Q3UA16 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spc25Q3UA16 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spc25Q3UA16 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spc25Q3UA16 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spc25Q3UA16 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spc25Q3UA16 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spc25Q3UA16 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spc25Q3UA16 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spc25Q3UA16 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms