Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde12Q3TIU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde12Q3TIU4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde12Q3TIU4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde12Q3TIU4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde12Q3TIU4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde12Q3TIU4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde12Q3TIU4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde12Q3TIU4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde12Q3TIU4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde12Q3TIU4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde12Q3TIU4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde12Q3TIU4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde12Q3TIU4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde12Q3TIU4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde12Q3TIU4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde12Q3TIU4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pde12Q3TIU4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde12Q3TIU4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde12Q3TIU4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde12Q3TIU4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde12Q3TIU4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde12Q3TIU4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde12Q3TIU4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde12Q3TIU4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde12Q3TIU4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde12Q3TIU4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde12Q3TIU4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde12Q3TIU4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde12Q3TIU4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde12Q3TIU4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde12Q3TIU4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde12Q3TIU4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde12Q3TIU4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde12Q3TIU4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde12Q3TIU4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde12Q3TIU4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde12Q3TIU4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde12Q3TIU4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms