Protein–RNA interactions for Protein: Q14B48

Ccdc129, Coiled-coil domain-containing protein 129, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc129Q14B48 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc129Q14B48 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc129Q14B48 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc129Q14B48 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc129Q14B48 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc129Q14B48 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc129Q14B48 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc129Q14B48 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc129Q14B48 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc129Q14B48 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc129Q14B48 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc129Q14B48 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc129Q14B48 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc129Q14B48 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc129Q14B48 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc129Q14B48 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc129Q14B48 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc129Q14B48 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc129Q14B48 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc129Q14B48 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc129Q14B48 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc129Q14B48 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc129Q14B48 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc129Q14B48 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc129Q14B48 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc129Q14B48 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc129Q14B48 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc129Q14B48 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc129Q14B48 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc129Q14B48 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc129Q14B48 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc129Q14B48 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc129Q14B48 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc129Q14B48 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc129Q14B48 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc129Q14B48 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc129Q14B48 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc129Q14B48 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc129Q14B48 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc129Q14B48 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc129Q14B48 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc129Q14B48 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc129Q14B48 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc129Q14B48 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc129Q14B48 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc129Q14B48 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc129Q14B48 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc129Q14B48 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc129Q14B48 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc129Q14B48 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc129Q14B48 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc129Q14B48 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc129Q14B48 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc129Q14B48 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc129Q14B48 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc129Q14B48 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc129Q14B48 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc129Q14B48 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc129Q14B48 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc129Q14B48 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc129Q14B48 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc129Q14B48 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc129Q14B48 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc129Q14B48 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc129Q14B48 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc129Q14B48 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc129Q14B48 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc129Q14B48 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc129Q14B48 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc129Q14B48 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc129Q14B48 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ccdc129Q14B48 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc129Q14B48 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc129Q14B48 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc129Q14B48 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc129Q14B48 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc129Q14B48 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc129Q14B48 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc129Q14B48 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc129Q14B48 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc129Q14B48 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc129Q14B48 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc129Q14B48 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc129Q14B48 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Ccdc129Q14B48 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms