Protein–RNA interactions for Protein: Q12408

NPC2, Phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPC2Q12408 PLB1YMR008C 1995 nt9.1□□□□□ -0.95
NPC2Q12408 POM34YLR018C 900 nt9.1□□□□□ -0.95
NPC2Q12408 COQ2YNR041C 1119 nt9.1□□□□□ -0.95
NPC2Q12408 SNF1YDR477W 1902 nt9.08□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 YCR087WYCR087W 516 nt9.08□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 PRO1YDR300C 1287 nt9.08□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 AAC1YMR056C 930 nt9.08□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 IRC24YIR036C 792 nt9.07□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 SBA1YKL117W 651 nt9.05□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 TOM6YOR045W 186 nt9.05□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 PAU21YOR394W 495 nt9.05□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 PAU22YPL282C 495 nt9.05□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 AIM45YPR004C 1035 nt9.05□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 MRP20YDR405W 792 nt9.03□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 YML089CYML089C 369 nt9.03□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 MET8YBR213W 825 nt9.03□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 GAP1YKR039W 1809 nt9.03□□□□□ -0.96
NPC2Q12408 ATG15YCR068W 1563 nt9□□□□□ -0.97
NPC2Q12408 RBG1YAL036C 1110 nt9□□□□□ -0.97
NPC2Q12408 HIP1YGR191W 1812 nt8.99□□□□□ -0.97
NPC2Q12408 MCH5YOR306C 1566 nt8.99□□□□□ -0.97
NPC2Q12408 PEX2YJL210W 816 nt8.98□□□□□ -0.97
NPC2Q12408 TIF6YPR016C 738 nt8.98□□□□□ -0.97
NPC2Q12408 ARO7YPR060C 771 nt8.97□□□□□ -0.97
NPC2Q12408 UTR1YJR049C 1593 nt8.97□□□□□ -0.97
NPC2Q12408 BIO5YNR056C 1686 nt8.97□□□□□ -0.97
NPC2Q12408 NDI1YML120C 1542 nt8.96□□□□□ -0.97
NPC2Q12408 RPL4BYDR012W 1089 nt8.96□□□□□ -0.98
NPC2Q12408 CLB6YGR109C 1143 nt8.96□□□□□ -0.98
NPC2Q12408 RPL4AYBR031W 1089 nt8.96□□□□□ -0.98
NPC2Q12408 RPS14BYJL191W 417 nt8.94□□□□□ -0.98
NPC2Q12408 PRM5YIL117C 957 nt8.93□□□□□ -0.98
NPC2Q12408 UTH1YKR042W 1098 nt8.91□□□□□ -0.98
NPC2Q12408 DIF1YLR437C 402 nt8.91□□□□□ -0.98
NPC2Q12408 MET28YIR017C 564 nt8.9□□□□□ -0.98
NPC2Q12408 NRT1YOR071C 1797 nt8.89□□□□□ -0.99
NPC2Q12408 GLR1YPL091W 1452 nt8.87□□□□□ -0.99
NPC2Q12408 YMR244WYMR244W 1068 nt8.86□□□□□ -0.99
NPC2Q12408 PBP1YGR178C 2169 nt8.83□□□□□ -1
NPC2Q12408 HIF1YLL022C 1158 nt8.82□□□□□ -1
NPC2Q12408 YAR028WYAR028W 705 nt8.82□□□□□ -1
NPC2Q12408 ALD4YOR374W 1560 nt8.82□□□□□ -1
NPC2Q12408 SAM35YHR083W 990 nt8.8□□□□□ -1
NPC2Q12408 FIT3YOR383C 615 nt8.8□□□□□ -1
NPC2Q12408 NAR1YNL240C 1476 nt8.8□□□□□ -1
NPC2Q12408 TSC10YBR265W 963 nt8.79□□□□□ -1
NPC2Q12408 MTG2YHR168W 1557 nt8.78□□□□□ -1
NPC2Q12408 ZTA1YBR046C 1005 nt8.78□□□□□ -1
NPC2Q12408 YLR279WYLR279W 390 nt8.77□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 SDH5YOL071W 489 nt8.76□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 DBP1YPL119C 1854 nt8.76□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 YGR012WYGR012W 1182 nt8.75□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 CYT2YKL087C 675 nt8.74□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 ALP1YNL270C 1722 nt8.74□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 AKR2YOR034C 2250 nt8.73□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 CAB5YDR196C 726 nt8.73□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 MSB4YOL112W 1479 nt8.72□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.72□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.72□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.72□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.72□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.72□□□□□ -1.01
NPC2Q12408 RAD23YEL037C 1197 nt8.71□□□□□ -1.02
NPC2Q12408 SED1YDR077W 1017 nt8.7□□□□□ -1.02
NPC2Q12408 RBG2YGR173W 1107 nt8.7□□□□□ -1.02
NPC2Q12408 YMR226CYMR226C 804 nt8.7□□□□□ -1.02
NPC2Q12408 YLR111WYLR111W 333 nt8.69□□□□□ -1.02
NPC2Q12408 HXT1YHR094C 1713 nt8.68□□□□□ -1.02
NPC2Q12408 LIP1YMR298W 453 nt8.68□□□□□ -1.02
NPC2Q12408 YBL086CYBL086C 1401 nt8.68□□□□□ -1.02
NPC2Q12408 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.66□□□□□ -1.02
NPC2Q12408 RIB3YDR487C 627 nt8.64□□□□□ -1.03
NPC2Q12408 YPL251WYPL251W 303 nt8.64□□□□□ -1.03
NPC2Q12408 LEU9YOR108W 1815 nt8.63□□□□□ -1.03
NPC2Q12408 SHY1YGR112W 1170 nt8.62□□□□□ -1.03
NPC2Q12408 REG2YBR050C 1017 nt8.62□□□□□ -1.03
NPC2Q12408 ZRT3YKL175W 1512 nt8.61□□□□□ -1.03
NPC2Q12408 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.61□□□□□ -1.03
NPC2Q12408 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.6□□□□□ -1.03
NPC2Q12408 FCY21YER060W 1587 nt8.59□□□□□ -1.03
NPC2Q12408 UGA4YDL210W 1716 nt8.59□□□□□ -1.03
NPC2Q12408 UFO1YML088W 2007 nt8.58□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 BRR1YPR057W 1026 nt8.58□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 YAT1YAR035W 2064 nt8.58□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 SAM1YLR180W 1149 nt8.57□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 YJR154WYJR154W 1041 nt8.56□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.55□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.55□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 GND1YHR183W 1470 nt8.54□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 YJL067WYJL067W 351 nt8.54□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 CMP2YML057W 1815 nt8.53□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 URA6YKL024C 615 nt8.53□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 TOA2YKL058W 369 nt8.53□□□□□ -1.04
NPC2Q12408 MEP3YPR138C 1470 nt8.52□□□□□ -1.05
NPC2Q12408 APT2YDR441C 546 nt8.52□□□□□ -1.05
NPC2Q12408 YMR103CYMR103C 363 nt8.52□□□□□ -1.05
NPC2Q12408 PAM17YKR065C 594 nt8.51□□□□□ -1.05
NPC2Q12408 GND2YGR256W 1479 nt8.51□□□□□ -1.05
NPC2Q12408 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.5□□□□□ -1.05
NPC2Q12408 SMM1YNR015W 1155 nt8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.2 ms