Protein–RNA interactions for Protein: Q08957

AFT2, Iron-regulated transcriptional activator AFT2, yeastyeast

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFT2Q08957 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.02□□□□□ -0.65
AFT2Q08957 GAP1YKR039W 1809 nt11□□□□□ -0.65
AFT2Q08957 PRM5YIL117C 957 nt11□□□□□ -0.65
AFT2Q08957 PHO89YBR296C 1725 nt11□□□□□ -0.65
AFT2Q08957 MSF1YPR047W 1410 nt11□□□□□ -0.65
AFT2Q08957 UTR1YJR049C 1593 nt10.99□□□□□ -0.65
AFT2Q08957 NAT4YMR069W 858 nt10.99□□□□□ -0.65
AFT2Q08957 TOM6YOR045W 186 nt10.98□□□□□ -0.65
AFT2Q08957 YSR3YKR053C 1215 nt10.97□□□□□ -0.65
AFT2Q08957 COQ2YNR041C 1119 nt10.94□□□□□ -0.66
AFT2Q08957 ATG15YCR068W 1563 nt10.94□□□□□ -0.66
AFT2Q08957 CYT2YKL087C 675 nt10.93□□□□□ -0.66
AFT2Q08957 XYL2YLR070C 1071 nt10.92□□□□□ -0.66
AFT2Q08957 YML089CYML089C 369 nt10.91□□□□□ -0.66
AFT2Q08957 YGL034CYGL034C 366 nt10.9□□□□□ -0.66
AFT2Q08957 HIF1YLL022C 1158 nt10.9□□□□□ -0.66
AFT2Q08957 PEX2YJL210W 816 nt10.88□□□□□ -0.67
AFT2Q08957 HIP1YGR191W 1812 nt10.86□□□□□ -0.67
AFT2Q08957 TIF6YPR016C 738 nt10.86□□□□□ -0.67
AFT2Q08957 ALD4YOR374W 1560 nt10.86□□□□□ -0.67
AFT2Q08957 DIF1YLR437C 402 nt10.85□□□□□ -0.67
AFT2Q08957 YCR087WYCR087W 516 nt10.82□□□□□ -0.68
AFT2Q08957 MRP20YDR405W 792 nt10.82□□□□□ -0.68
AFT2Q08957 AIM45YPR004C 1035 nt10.8□□□□□ -0.68
AFT2Q08957 YAT1YAR035W 2064 nt10.78□□□□□ -0.68
AFT2Q08957 SAM35YHR083W 990 nt10.74□□□□□ -0.69
AFT2Q08957 RBG1YAL036C 1110 nt10.74□□□□□ -0.69
AFT2Q08957 DBP1YPL119C 1854 nt10.73□□□□□ -0.69
AFT2Q08957 RPL4BYDR012W 1089 nt10.73□□□□□ -0.69
AFT2Q08957 MET28YIR017C 564 nt10.73□□□□□ -0.69
AFT2Q08957 RPL4AYBR031W 1089 nt10.73□□□□□ -0.69
AFT2Q08957 RPS14BYJL191W 417 nt10.72□□□□□ -0.69
AFT2Q08957 NRT1YOR071C 1797 nt10.7□□□□□ -0.7
AFT2Q08957 UTH1YKR042W 1098 nt10.7□□□□□ -0.7
AFT2Q08957 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.68□□□□□ -0.7
AFT2Q08957 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.68□□□□□ -0.7
AFT2Q08957 YAR028WYAR028W 705 nt10.68□□□□□ -0.7
AFT2Q08957 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.68□□□□□ -0.7
AFT2Q08957 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.68□□□□□ -0.7
AFT2Q08957 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.68□□□□□ -0.7
AFT2Q08957 MTG2YHR168W 1557 nt10.68□□□□□ -0.7
AFT2Q08957 CLB6YGR109C 1143 nt10.66□□□□□ -0.7
AFT2Q08957 ZTA1YBR046C 1005 nt10.66□□□□□ -0.7
AFT2Q08957 NDI1YML120C 1542 nt10.64□□□□□ -0.71
AFT2Q08957 HXT1YHR094C 1713 nt10.64□□□□□ -0.71
AFT2Q08957 YBL086CYBL086C 1401 nt10.62□□□□□ -0.71
AFT2Q08957 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.62□□□□□ -0.71
AFT2Q08957 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.62□□□□□ -0.71
AFT2Q08957 ZRT3YKL175W 1512 nt10.6□□□□□ -0.71
AFT2Q08957 SED1YDR077W 1017 nt10.59□□□□□ -0.71
AFT2Q08957 LIP1YMR298W 453 nt10.59□□□□□ -0.71
AFT2Q08957 AKR2YOR034C 2250 nt10.59□□□□□ -0.71
AFT2Q08957 SHY1YGR112W 1170 nt10.58□□□□□ -0.72
AFT2Q08957 FIT3YOR383C 615 nt10.58□□□□□ -0.72
AFT2Q08957 ALP1YNL270C 1722 nt10.57□□□□□ -0.72
AFT2Q08957 RPC82YPR190C 1965 nt10.57□□□□□ -0.72
AFT2Q08957 YJL067WYJL067W 351 nt10.55□□□□□ -0.72
AFT2Q08957 SBA1YKL117W 651 nt10.55□□□□□ -0.72
AFT2Q08957 YLR279WYLR279W 390 nt10.54□□□□□ -0.72
AFT2Q08957 YPL251WYPL251W 303 nt10.54□□□□□ -0.72
AFT2Q08957 LEU9YOR108W 1815 nt10.52□□□□□ -0.73
AFT2Q08957 TSC10YBR265W 963 nt10.52□□□□□ -0.73
AFT2Q08957 UFO1YML088W 2007 nt10.51□□□□□ -0.73
AFT2Q08957 MSB4YOL112W 1479 nt10.5□□□□□ -0.73
AFT2Q08957 CMP2YML057W 1815 nt10.5□□□□□ -0.73
AFT2Q08957 INA1YLR413W 2028 nt10.48□□□□□ -0.73
AFT2Q08957 YGR012WYGR012W 1182 nt10.48□□□□□ -0.73
AFT2Q08957 CAB5YDR196C 726 nt10.47□□□□□ -0.73
AFT2Q08957 BRR1YPR057W 1026 nt10.47□□□□□ -0.73
AFT2Q08957 SDH5YOL071W 489 nt10.46□□□□□ -0.73
AFT2Q08957 SPT20YOL148C 1815 nt10.45□□□□□ -0.74
AFT2Q08957 GLR1YPL091W 1452 nt10.45□□□□□ -0.74
AFT2Q08957 SAM1YLR180W 1149 nt10.45□□□□□ -0.74
AFT2Q08957 URA6YKL024C 615 nt10.44□□□□□ -0.74
AFT2Q08957 TOA2YKL058W 369 nt10.43□□□□□ -0.74
AFT2Q08957 UGA4YDL210W 1716 nt10.42□□□□□ -0.74
AFT2Q08957 YMR103CYMR103C 363 nt10.41□□□□□ -0.74
AFT2Q08957 YMR244WYMR244W 1068 nt10.41□□□□□ -0.74
AFT2Q08957 GND2YGR256W 1479 nt10.4□□□□□ -0.74
AFT2Q08957 MEP3YPR138C 1470 nt10.38□□□□□ -0.75
AFT2Q08957 RAD23YEL037C 1197 nt10.37□□□□□ -0.75
AFT2Q08957 OYE3YPL171C 1203 nt10.37□□□□□ -0.75
AFT2Q08957 HSL7YBR133C 2484 nt10.37□□□□□ -0.75
AFT2Q08957 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.36□□□□□ -0.75
AFT2Q08957 FCY21YER060W 1587 nt10.35□□□□□ -0.75
AFT2Q08957 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.31□□□□□ -0.76
AFT2Q08957 RIB3YDR487C 627 nt10.3□□□□□ -0.76
AFT2Q08957 YLR111WYLR111W 333 nt10.3□□□□□ -0.76
AFT2Q08957 PET8YNL003C 855 nt10.3□□□□□ -0.76
AFT2Q08957 YOR325WYOR325W 474 nt10.3□□□□□ -0.76
AFT2Q08957 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.3□□□□□ -0.76
AFT2Q08957 FLR1YBR008C 1647 nt10.29□□□□□ -0.76
AFT2Q08957 FMS1YMR020W 1527 nt10.27□□□□□ -0.77
AFT2Q08957 SSN3YPL042C 1668 nt10.26□□□□□ -0.77
AFT2Q08957 CWC15YDR163W 528 nt10.26□□□□□ -0.77
AFT2Q08957 ILV3YJR016C 1758 nt10.25□□□□□ -0.77
AFT2Q08957 APT2YDR441C 546 nt10.25□□□□□ -0.77
AFT2Q08957 ACH1YBL015W 1581 nt10.25□□□□□ -0.77
AFT2Q08957 YMR226CYMR226C 804 nt10.24□□□□□ -0.77
AFT2Q08957 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.8 ms