Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CbfbQ08024 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CbfbQ08024 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CbfbQ08024 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CbfbQ08024 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CbfbQ08024 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CbfbQ08024 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CbfbQ08024 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CbfbQ08024 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CbfbQ08024 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CbfbQ08024 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CbfbQ08024 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CbfbQ08024 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CbfbQ08024 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CbfbQ08024 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CbfbQ08024 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CbfbQ08024 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CbfbQ08024 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CbfbQ08024 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CbfbQ08024 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CbfbQ08024 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CbfbQ08024 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CbfbQ08024 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CbfbQ08024 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms