Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah2Q06986 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah2Q06986 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah2Q06986 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah2Q06986 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah2Q06986 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah2Q06986 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah2Q06986 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah2Q06986 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah2Q06986 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah2Q06986 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah2Q06986 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah2Q06986 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah2Q06986 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah2Q06986 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah2Q06986 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah2Q06986 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah2Q06986 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah2Q06986 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah2Q06986 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Siah2Q06986 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Siah2Q06986 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah2Q06986 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah2Q06986 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah2Q06986 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah2Q06986 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah2Q06986 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah2Q06986 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms