Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Cacna1sQ02789 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Cacna1sQ02789 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Cacna1sQ02789 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Cacna1sQ02789 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Cacna1sQ02789 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Cacna1sQ02789 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
Cacna1sQ02789 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Cacna1sQ02789 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Cacna1sQ02789 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Cacna1sQ02789 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Cacna1sQ02789 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Cacna1sQ02789 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Cacna1sQ02789 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Cacna1sQ02789 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,01■■■■□ 3,04
Cacna1sQ02789 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Cacna1sQ02789 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Cacna1sQ02789 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Cacna1sQ02789 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Cacna1sQ02789 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,03
Cacna1sQ02789 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Cacna1sQ02789 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Cacna1sQ02789 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Cacna1sQ02789 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Cacna1sQ02789 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Cacna1sQ02789 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Cacna1sQ02789 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Cacna1sQ02789 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Cacna1sQ02789 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Cacna1sQ02789 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Cacna1sQ02789 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Cacna1sQ02789 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33,81■■■■□ 3
Cacna1sQ02789 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Cacna1sQ02789 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Cacna1sQ02789 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33,78■■■■□ 3
Cacna1sQ02789 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33,76■■■■□ 3
Cacna1sQ02789 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Cacna1sQ02789 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Cacna1sQ02789 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Cacna1sQ02789 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Cacna1sQ02789 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Cacna1sQ02789 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Cacna1sQ02789 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Cacna1sQ02789 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Cacna1sQ02789 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Cacna1sQ02789 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Cacna1sQ02789 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Cacna1sQ02789 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Cacna1sQ02789 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Cacna1sQ02789 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Cacna1sQ02789 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Cacna1sQ02789 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
Cacna1sQ02789 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Cacna1sQ02789 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33,51■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33,46■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33,46■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cacna1sQ02789 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Cacna1sQ02789 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cacna1sQ02789 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cacna1sQ02789 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cacna1sQ02789 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cacna1sQ02789 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Cacna1sQ02789 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33,37■■■□□ 2,93
Cacna1sQ02789 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Cacna1sQ02789 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33,35■■■□□ 2,93
Cacna1sQ02789 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Cacna1sQ02789 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Cacna1sQ02789 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Cacna1sQ02789 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Cacna1sQ02789 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Cacna1sQ02789 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cacna1sQ02789 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cacna1sQ02789 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Cacna1sQ02789 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Cacna1sQ02789 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms