Protein–RNA interactions for Protein: P98154

Dgcr2, Integral membrane protein DGCR2/IDD, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr2P98154 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dgcr2P98154 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dgcr2P98154 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dgcr2P98154 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dgcr2P98154 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dgcr2P98154 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dgcr2P98154 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dgcr2P98154 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dgcr2P98154 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dgcr2P98154 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dgcr2P98154 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dgcr2P98154 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dgcr2P98154 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dgcr2P98154 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dgcr2P98154 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dgcr2P98154 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dgcr2P98154 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dgcr2P98154 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dgcr2P98154 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dgcr2P98154 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dgcr2P98154 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dgcr2P98154 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dgcr2P98154 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dgcr2P98154 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dgcr2P98154 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dgcr2P98154 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dgcr2P98154 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dgcr2P98154 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dgcr2P98154 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dgcr2P98154 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dgcr2P98154 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dgcr2P98154 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dgcr2P98154 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dgcr2P98154 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dgcr2P98154 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms