Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smad4P97471 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smad4P97471 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smad4P97471 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smad4P97471 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smad4P97471 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smad4P97471 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smad4P97471 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smad4P97471 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smad4P97471 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smad4P97471 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smad4P97471 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smad4P97471 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smad4P97471 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smad4P97471 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smad4P97471 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Smad4P97471 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smad4P97471 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Smad4P97471 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smad4P97471 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smad4P97471 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smad4P97471 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Smad4P97471 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smad4P97471 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smad4P97471 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smad4P97471 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smad4P97471 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smad4P97471 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smad4P97471 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smad4P97471 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smad4P97471 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smad4P97471 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Smad4P97471 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Smad4P97471 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smad4P97471 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smad4P97471 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smad4P97471 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smad4P97471 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smad4P97471 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smad4P97471 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smad4P97471 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smad4P97471 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smad4P97471 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smad4P97471 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smad4P97471 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smad4P97471 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smad4P97471 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smad4P97471 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smad4P97471 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smad4P97471 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smad4P97471 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smad4P97471 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smad4P97471 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smad4P97471 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smad4P97471 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smad4P97471 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smad4P97471 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smad4P97471 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smad4P97471 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smad4P97471 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smad4P97471 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smad4P97471 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smad4P97471 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smad4P97471 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smad4P97471 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smad4P97471 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smad4P97471 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smad4P97471 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smad4P97471 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smad4P97471 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smad4P97471 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smad4P97471 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smad4P97471 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smad4P97471 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smad4P97471 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smad4P97471 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms