Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmklr1P97468 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmklr1P97468 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmklr1P97468 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmklr1P97468 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmklr1P97468 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cmklr1P97468 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmklr1P97468 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cmklr1P97468 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmklr1P97468 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmklr1P97468 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmklr1P97468 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmklr1P97468 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmklr1P97468 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmklr1P97468 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cmklr1P97468 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cmklr1P97468 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmklr1P97468 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cmklr1P97468 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms