Protein–RNA interactions for Protein: P97315

Csrp1, Cysteine and glycine-rich protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp1P97315 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrp1P97315 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrp1P97315 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrp1P97315 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrp1P97315 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrp1P97315 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrp1P97315 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrp1P97315 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrp1P97315 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrp1P97315 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrp1P97315 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrp1P97315 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrp1P97315 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrp1P97315 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrp1P97315 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrp1P97315 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrp1P97315 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrp1P97315 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrp1P97315 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrp1P97315 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrp1P97315 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrp1P97315 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrp1P97315 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrp1P97315 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrp1P97315 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrp1P97315 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrp1P97315 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrp1P97315 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csrp1P97315 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrp1P97315 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrp1P97315 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrp1P97315 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrp1P97315 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Csrp1P97315 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrp1P97315 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrp1P97315 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrp1P97315 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrp1P97315 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrp1P97315 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrp1P97315 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrp1P97315 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csrp1P97315 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrp1P97315 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csrp1P97315 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csrp1P97315 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrp1P97315 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csrp1P97315 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrp1P97315 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrp1P97315 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csrp1P97315 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Csrp1P97315 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrp1P97315 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrp1P97315 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrp1P97315 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrp1P97315 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrp1P97315 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrp1P97315 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrp1P97315 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrp1P97315 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrp1P97315 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrp1P97315 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrp1P97315 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrp1P97315 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrp1P97315 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrp1P97315 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csrp1P97315 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrp1P97315 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csrp1P97315 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrp1P97315 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csrp1P97315 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrp1P97315 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csrp1P97315 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csrp1P97315 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms