Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hps5P59438 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hps5P59438 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hps5P59438 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hps5P59438 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hps5P59438 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hps5P59438 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hps5P59438 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hps5P59438 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Hps5P59438 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hps5P59438 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hps5P59438 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hps5P59438 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hps5P59438 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hps5P59438 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hps5P59438 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hps5P59438 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hps5P59438 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hps5P59438 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hps5P59438 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hps5P59438 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hps5P59438 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hps5P59438 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Hps5P59438 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hps5P59438 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hps5P59438 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Hps5P59438 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hps5P59438 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Hps5P59438 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hps5P59438 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hps5P59438 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hps5P59438 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hps5P59438 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hps5P59438 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Hps5P59438 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hps5P59438 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hps5P59438 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hps5P59438 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hps5P59438 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hps5P59438 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hps5P59438 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hps5P59438 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Hps5P59438 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hps5P59438 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hps5P59438 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hps5P59438 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hps5P59438 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Hps5P59438 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hps5P59438 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hps5P59438 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hps5P59438 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hps5P59438 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hps5P59438 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hps5P59438 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hps5P59438 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Hps5P59438 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hps5P59438 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hps5P59438 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hps5P59438 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hps5P59438 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hps5P59438 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hps5P59438 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hps5P59438 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hps5P59438 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Hps5P59438 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hps5P59438 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hps5P59438 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hps5P59438 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hps5P59438 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hps5P59438 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Hps5P59438 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hps5P59438 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hps5P59438 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hps5P59438 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hps5P59438 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hps5P59438 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hps5P59438 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hps5P59438 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hps5P59438 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hps5P59438 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hps5P59438 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hps5P59438 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Hps5P59438 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hps5P59438 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hps5P59438 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hps5P59438 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hps5P59438 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hps5P59438 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hps5P59438 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms