Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rce1P57791 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rce1P57791 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rce1P57791 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rce1P57791 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rce1P57791 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rce1P57791 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rce1P57791 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rce1P57791 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rce1P57791 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rce1P57791 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rce1P57791 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rce1P57791 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rce1P57791 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rce1P57791 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rce1P57791 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rce1P57791 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rce1P57791 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rce1P57791 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rce1P57791 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rce1P57791 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rce1P57791 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rce1P57791 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rce1P57791 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rce1P57791 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rce1P57791 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rce1P57791 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rce1P57791 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rce1P57791 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rce1P57791 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rce1P57791 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rce1P57791 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rce1P57791 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rce1P57791 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rce1P57791 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rce1P57791 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rce1P57791 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rce1P57791 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rce1P57791 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms