Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd38P56528 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd38P56528 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd38P56528 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd38P56528 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd38P56528 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd38P56528 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd38P56528 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd38P56528 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd38P56528 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd38P56528 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd38P56528 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd38P56528 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd38P56528 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd38P56528 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd38P56528 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd38P56528 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd38P56528 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd38P56528 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd38P56528 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd38P56528 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd38P56528 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd38P56528 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd38P56528 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd38P56528 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd38P56528 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd38P56528 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd38P56528 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd38P56528 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd38P56528 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd38P56528 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd38P56528 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd38P56528 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd38P56528 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd38P56528 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd38P56528 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd38P56528 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms