Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Ptpn5P54830 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ptpn5P54830 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ptpn5P54830 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ptpn5P54830 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ptpn5P54830 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Ptpn5P54830 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Ptpn5P54830 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Ptpn5P54830 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Ptpn5P54830 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ptpn5P54830 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ptpn5P54830 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ptpn5P54830 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ptpn5P54830 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ptpn5P54830 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ptpn5P54830 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Ptpn5P54830 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ptpn5P54830 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ptpn5P54830 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Ptpn5P54830 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ptpn5P54830 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ptpn5P54830 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ptpn5P54830 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Ptpn5P54830 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ptpn5P54830 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ptpn5P54830 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ptpn5P54830 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ptpn5P54830 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ptpn5P54830 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Ptpn5P54830 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Ptpn5P54830 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Ptpn5P54830 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Ptpn5P54830 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ptpn5P54830 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Ptpn5P54830 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Ptpn5P54830 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ptpn5P54830 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ptpn5P54830 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Ptpn5P54830 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Ptpn5P54830 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ptpn5P54830 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ptpn5P54830 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ptpn5P54830 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ptpn5P54830 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Ptpn5P54830 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Ptpn5P54830 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Ptpn5P54830 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Ptpn5P54830 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ptpn5P54830 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ptpn5P54830 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ptpn5P54830 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ptpn5P54830 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ptpn5P54830 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ptpn5P54830 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ptpn5P54830 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Ptpn5P54830 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Ptpn5P54830 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Ptpn5P54830 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Ptpn5P54830 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ptpn5P54830 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ptpn5P54830 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ptpn5P54830 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ptpn5P54830 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ptpn5P54830 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ptpn5P54830 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ptpn5P54830 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ptpn5P54830 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Ptpn5P54830 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ptpn5P54830 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ptpn5P54830 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ptpn5P54830 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms