Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Opn1swP51491 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Opn1swP51491 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Opn1swP51491 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Opn1swP51491 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Opn1swP51491 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Opn1swP51491 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Opn1swP51491 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Opn1swP51491 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Opn1swP51491 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Opn1swP51491 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Opn1swP51491 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Opn1swP51491 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Opn1swP51491 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Opn1swP51491 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Opn1swP51491 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Opn1swP51491 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Opn1swP51491 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Opn1swP51491 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Opn1swP51491 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Opn1swP51491 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Opn1swP51491 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Opn1swP51491 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Opn1swP51491 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn1swP51491 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms