Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcl5P50228 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcl5P50228 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxcl5P50228 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cxcl5P50228 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl5P50228 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl5P50228 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl5P50228 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl5P50228 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl5P50228 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl5P50228 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl5P50228 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl5P50228 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl5P50228 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl5P50228 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl5P50228 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cxcl5P50228 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl5P50228 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl5P50228 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl5P50228 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl5P50228 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl5P50228 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl5P50228 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl5P50228 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl5P50228 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl5P50228 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cxcl5P50228 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl5P50228 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl5P50228 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl5P50228 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cxcl5P50228 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms