Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
PcntP48725 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
PcntP48725 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
PcntP48725 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
PcntP48725 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
PcntP48725 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
PcntP48725 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
PcntP48725 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
PcntP48725 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
PcntP48725 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
PcntP48725 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,49■■□□□ 1,99
PcntP48725 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
PcntP48725 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
PcntP48725 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
PcntP48725 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
PcntP48725 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
PcntP48725 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
PcntP48725 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
PcntP48725 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
PcntP48725 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
PcntP48725 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,43■■□□□ 1,98
PcntP48725 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
PcntP48725 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
PcntP48725 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,4■■□□□ 1,98
PcntP48725 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
PcntP48725 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
PcntP48725 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27,35■■□□□ 1,97
PcntP48725 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
PcntP48725 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27,34■■□□□ 1,97
PcntP48725 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
PcntP48725 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
PcntP48725 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27,31■■□□□ 1,96
PcntP48725 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
PcntP48725 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
PcntP48725 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
PcntP48725 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
PcntP48725 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,28■■□□□ 1,96
PcntP48725 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
PcntP48725 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
PcntP48725 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
PcntP48725 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
PcntP48725 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
PcntP48725 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
PcntP48725 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
PcntP48725 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
PcntP48725 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
PcntP48725 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
PcntP48725 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
PcntP48725 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
PcntP48725 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
PcntP48725 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,17■■□□□ 1,94
PcntP48725 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,17■■□□□ 1,94
PcntP48725 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
PcntP48725 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
PcntP48725 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,16■■□□□ 1,94
PcntP48725 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
PcntP48725 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
PcntP48725 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
PcntP48725 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
PcntP48725 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27,12■■□□□ 1,93
PcntP48725 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
PcntP48725 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
PcntP48725 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
PcntP48725 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27,11■■□□□ 1,93
PcntP48725 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
PcntP48725 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
PcntP48725 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
PcntP48725 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,09■■□□□ 1,93
PcntP48725 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,09■■□□□ 1,93
PcntP48725 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
PcntP48725 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
PcntP48725 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
PcntP48725 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
PcntP48725 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
PcntP48725 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
PcntP48725 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
PcntP48725 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
PcntP48725 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
PcntP48725 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
PcntP48725 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
PcntP48725 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
PcntP48725 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
PcntP48725 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
PcntP48725 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
PcntP48725 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
PcntP48725 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
PcntP48725 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
PcntP48725 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
PcntP48725 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
PcntP48725 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
PcntP48725 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26,96■■□□□ 1,91
PcntP48725 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
PcntP48725 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
PcntP48725 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26,95■■□□□ 1,9
PcntP48725 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,95■■□□□ 1,9
PcntP48725 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
PcntP48725 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
PcntP48725 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
PcntP48725 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
PcntP48725 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,6 ms