Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
InaP46660 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
InaP46660 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
InaP46660 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
InaP46660 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
InaP46660 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
InaP46660 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
InaP46660 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
InaP46660 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
InaP46660 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
InaP46660 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
InaP46660 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
InaP46660 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
InaP46660 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
InaP46660 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
InaP46660 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
InaP46660 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
InaP46660 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
InaP46660 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
InaP46660 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
InaP46660 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
InaP46660 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
InaP46660 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
InaP46660 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
InaP46660 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
InaP46660 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
InaP46660 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
InaP46660 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
InaP46660 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
InaP46660 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
InaP46660 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
InaP46660 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
InaP46660 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
InaP46660 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
InaP46660 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
InaP46660 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
InaP46660 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
InaP46660 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
InaP46660 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
InaP46660 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
InaP46660 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
InaP46660 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
InaP46660 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
InaP46660 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
InaP46660 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
InaP46660 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
InaP46660 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
InaP46660 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
InaP46660 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
InaP46660 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
InaP46660 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
InaP46660 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
InaP46660 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
InaP46660 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
InaP46660 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
InaP46660 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
InaP46660 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
InaP46660 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
InaP46660 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
InaP46660 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
InaP46660 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
InaP46660 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
InaP46660 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
InaP46660 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
InaP46660 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
InaP46660 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
InaP46660 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
InaP46660 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
InaP46660 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
InaP46660 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
InaP46660 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
InaP46660 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
InaP46660 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
InaP46660 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
InaP46660 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
InaP46660 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
InaP46660 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
InaP46660 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
InaP46660 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
InaP46660 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
InaP46660 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
InaP46660 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
InaP46660 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
InaP46660 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
InaP46660 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
InaP46660 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
InaP46660 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
InaP46660 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
InaP46660 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
InaP46660 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
InaP46660 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
InaP46660 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
InaP46660 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
InaP46660 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
InaP46660 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
InaP46660 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
InaP46660 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
InaP46660 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
InaP46660 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
InaP46660 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms