Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gjb1P28230 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gjb1P28230 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gjb1P28230 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gjb1P28230 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gjb1P28230 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gjb1P28230 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gjb1P28230 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjb1P28230 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjb1P28230 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjb1P28230 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjb1P28230 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjb1P28230 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gjb1P28230 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gjb1P28230 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gjb1P28230 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Gjb1P28230 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gjb1P28230 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gjb1P28230 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gjb1P28230 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gjb1P28230 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gjb1P28230 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gjb1P28230 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gjb1P28230 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gjb1P28230 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Gjb1P28230 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gjb1P28230 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gjb1P28230 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gjb1P28230 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gjb1P28230 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gjb1P28230 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gjb1P28230 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gjb1P28230 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gjb1P28230 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gjb1P28230 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gjb1P28230 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gjb1P28230 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gjb1P28230 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gjb1P28230 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gjb1P28230 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gjb1P28230 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gjb1P28230 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Gjb1P28230 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Gjb1P28230 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gjb1P28230 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gjb1P28230 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gjb1P28230 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gjb1P28230 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gjb1P28230 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gjb1P28230 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gjb1P28230 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gjb1P28230 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gjb1P28230 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gjb1P28230 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gjb1P28230 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gjb1P28230 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gjb1P28230 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gjb1P28230 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gjb1P28230 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gjb1P28230 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gjb1P28230 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gjb1P28230 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gjb1P28230 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gjb1P28230 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gjb1P28230 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gjb1P28230 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gjb1P28230 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gjb1P28230 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gjb1P28230 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gjb1P28230 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gjb1P28230 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gjb1P28230 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gjb1P28230 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gjb1P28230 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gjb1P28230 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gjb1P28230 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gjb1P28230 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gjb1P28230 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms