Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd40lgP27548 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd40lgP27548 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd40lgP27548 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd40lgP27548 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd40lgP27548 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd40lgP27548 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd40lgP27548 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd40lgP27548 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd40lgP27548 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd40lgP27548 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd40lgP27548 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd40lgP27548 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd40lgP27548 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd40lgP27548 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd40lgP27548 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd40lgP27548 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd40lgP27548 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd40lgP27548 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd40lgP27548 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd40lgP27548 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd40lgP27548 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd40lgP27548 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd40lgP27548 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd40lgP27548 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd40lgP27548 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd40lgP27548 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd40lgP27548 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd40lgP27548 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd40lgP27548 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd40lgP27548 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd40lgP27548 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd40lgP27548 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd40lgP27548 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd40lgP27548 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd40lgP27548 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd40lgP27548 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd40lgP27548 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd40lgP27548 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms