Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HdcP23738 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HdcP23738 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HdcP23738 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HdcP23738 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HdcP23738 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HdcP23738 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HdcP23738 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HdcP23738 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HdcP23738 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HdcP23738 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HdcP23738 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HdcP23738 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HdcP23738 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HdcP23738 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HdcP23738 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HdcP23738 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HdcP23738 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HdcP23738 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HdcP23738 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HdcP23738 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HdcP23738 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HdcP23738 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HdcP23738 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HdcP23738 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HdcP23738 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HdcP23738 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HdcP23738 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HdcP23738 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HdcP23738 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HdcP23738 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HdcP23738 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HdcP23738 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HdcP23738 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HdcP23738 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HdcP23738 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HdcP23738 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HdcP23738 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HdcP23738 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HdcP23738 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HdcP23738 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HdcP23738 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HdcP23738 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HdcP23738 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HdcP23738 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HdcP23738 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HdcP23738 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HdcP23738 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HdcP23738 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HdcP23738 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HdcP23738 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HdcP23738 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HdcP23738 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HdcP23738 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HdcP23738 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HdcP23738 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HdcP23738 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HdcP23738 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HdcP23738 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HdcP23738 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HdcP23738 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HdcP23738 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HdcP23738 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HdcP23738 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HdcP23738 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HdcP23738 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HdcP23738 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HdcP23738 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HdcP23738 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HdcP23738 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HdcP23738 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HdcP23738 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HdcP23738 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HdcP23738 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HdcP23738 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HdcP23738 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HdcP23738 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HdcP23738 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HdcP23738 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HdcP23738 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HdcP23738 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HdcP23738 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HdcP23738 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HdcP23738 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HdcP23738 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HdcP23738 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HdcP23738 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HdcP23738 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HdcP23738 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HdcP23738 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HdcP23738 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HdcP23738 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HdcP23738 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HdcP23738 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HdcP23738 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HdcP23738 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HdcP23738 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HdcP23738 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HdcP23738 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HdcP23738 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms