Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Lama1P19137 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Lama1P19137 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Lama1P19137 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Lama1P19137 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Lama1P19137 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Lama1P19137 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Lama1P19137 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Lama1P19137 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Lama1P19137 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Lama1P19137 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Lama1P19137 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Lama1P19137 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Lama1P19137 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Lama1P19137 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Lama1P19137 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Lama1P19137 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Lama1P19137 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Lama1P19137 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Lama1P19137 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Lama1P19137 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Lama1P19137 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Lama1P19137 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Lama1P19137 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Lama1P19137 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Lama1P19137 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Lama1P19137 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Lama1P19137 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Lama1P19137 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Lama1P19137 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Lama1P19137 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24,58■■□□□ 1,53
Lama1P19137 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,52
Lama1P19137 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Lama1P19137 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Lama1P19137 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Lama1P19137 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Lama1P19137 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Lama1P19137 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24,49■■□□□ 1,51
Lama1P19137 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
Lama1P19137 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Lama1P19137 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Lama1P19137 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Lama1P19137 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Lama1P19137 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Lama1P19137 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Lama1P19137 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Lama1P19137 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Lama1P19137 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Lama1P19137 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Lama1P19137 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Lama1P19137 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Lama1P19137 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Lama1P19137 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24,35■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Lama1P19137 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Lama1P19137 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Lama1P19137 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24,27■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Lama1P19137 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Lama1P19137 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Lama1P19137 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Lama1P19137 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Lama1P19137 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Lama1P19137 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms