Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama1P19137 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama1P19137 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama1P19137 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama1P19137 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama1P19137 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama1P19137 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama1P19137 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lama1P19137 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lama1P19137 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lama1P19137 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama1P19137 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama1P19137 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama1P19137 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama1P19137 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama1P19137 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama1P19137 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama1P19137 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lama1P19137 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama1P19137 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama1P19137 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama1P19137 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lama1P19137 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lama1P19137 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama1P19137 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama1P19137 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama1P19137 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama1P19137 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lama1P19137 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lama1P19137 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lama1P19137 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lama1P19137 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lama1P19137 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lama1P19137 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama1P19137 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama1P19137 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama1P19137 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama1P19137 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama1P19137 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama1P19137 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lama1P19137 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama1P19137 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lama1P19137 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama1P19137 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama1P19137 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama1P19137 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama1P19137 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama1P19137 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama1P19137 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama1P19137 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama1P19137 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama1P19137 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama1P19137 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama1P19137 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lama1P19137 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lama1P19137 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama1P19137 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama1P19137 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama1P19137 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama1P19137 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama1P19137 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama1P19137 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms