Protein–RNA interactions for Protein: P10749

Il1b, Interleukin-1 beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1bP10749 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Il1bP10749 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Il1bP10749 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Il1bP10749 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Il1bP10749 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Il1bP10749 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Il1bP10749 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Il1bP10749 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Il1bP10749 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Il1bP10749 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Il1bP10749 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Il1bP10749 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Il1bP10749 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Il1bP10749 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il1bP10749 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il1bP10749 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il1bP10749 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Il1bP10749 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il1bP10749 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il1bP10749 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Il1bP10749 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il1bP10749 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il1bP10749 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il1bP10749 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Il1bP10749 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Il1bP10749 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Il1bP10749 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Il1bP10749 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Il1bP10749 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Il1bP10749 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il1bP10749 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il1bP10749 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Il1bP10749 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Il1bP10749 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il1bP10749 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Il1bP10749 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Il1bP10749 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Il1bP10749 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Il1bP10749 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms