Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P10404 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P10404 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P10404 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P10404 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P10404 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P10404 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P10404 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P10404 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P10404 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P10404 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P10404 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P10404 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P10404 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P10404 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P10404 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P10404 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P10404 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P10404 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P10404 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P10404 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P10404 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P10404 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P10404 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P10404 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P10404 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P10404 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P10404 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P10404 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P10404 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P10404 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P10404 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P10404 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P10404 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P10404 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P10404 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P10404 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P10404 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P10404 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P10404 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P10404 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P10404 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P10404 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P10404 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P10404 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P10404 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P10404 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P10404 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P10404 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P10404 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P10404 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P10404 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P10404 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P10404 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P10404 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P10404 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P10404 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
P10404 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
P10404 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
P10404 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P10404 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P10404 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
P10404 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P10404 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P10404 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P10404 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21■□□□□ 0.95
P10404 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
P10404 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P10404 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P10404 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P10404 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
P10404 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P10404 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P10404 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P10404 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
P10404 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P10404 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
P10404 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P10404 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P10404 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P10404 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P10404 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
P10404 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P10404 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P10404 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P10404 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P10404 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P10404 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P10404 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
P10404 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
P10404 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
P10404 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
P10404 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
P10404 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
P10404 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P10404 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
P10404 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P10404 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P10404 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
P10404 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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