Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DcxO88809 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DcxO88809 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DcxO88809 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DcxO88809 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DcxO88809 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DcxO88809 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DcxO88809 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DcxO88809 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DcxO88809 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DcxO88809 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DcxO88809 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DcxO88809 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DcxO88809 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DcxO88809 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DcxO88809 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DcxO88809 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DcxO88809 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DcxO88809 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DcxO88809 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DcxO88809 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DcxO88809 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DcxO88809 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DcxO88809 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DcxO88809 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DcxO88809 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DcxO88809 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DcxO88809 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DcxO88809 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DcxO88809 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DcxO88809 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DcxO88809 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DcxO88809 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DcxO88809 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DcxO88809 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DcxO88809 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DcxO88809 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DcxO88809 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DcxO88809 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DcxO88809 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DcxO88809 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DcxO88809 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DcxO88809 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DcxO88809 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DcxO88809 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DcxO88809 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DcxO88809 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DcxO88809 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DcxO88809 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DcxO88809 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DcxO88809 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DcxO88809 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DcxO88809 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DcxO88809 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DcxO88809 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DcxO88809 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DcxO88809 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DcxO88809 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DcxO88809 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DcxO88809 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DcxO88809 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DcxO88809 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DcxO88809 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DcxO88809 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DcxO88809 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DcxO88809 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DcxO88809 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DcxO88809 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DcxO88809 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DcxO88809 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DcxO88809 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DcxO88809 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DcxO88809 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DcxO88809 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DcxO88809 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DcxO88809 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DcxO88809 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DcxO88809 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DcxO88809 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DcxO88809 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DcxO88809 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DcxO88809 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DcxO88809 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DcxO88809 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DcxO88809 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DcxO88809 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DcxO88809 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DcxO88809 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DcxO88809 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DcxO88809 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DcxO88809 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DcxO88809 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DcxO88809 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DcxO88809 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DcxO88809 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DcxO88809 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DcxO88809 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DcxO88809 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DcxO88809 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DcxO88809 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms