Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vti1bO88384 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vti1bO88384 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vti1bO88384 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vti1bO88384 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vti1bO88384 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vti1bO88384 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vti1bO88384 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vti1bO88384 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vti1bO88384 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vti1bO88384 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vti1bO88384 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vti1bO88384 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vti1bO88384 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vti1bO88384 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vti1bO88384 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vti1bO88384 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vti1bO88384 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vti1bO88384 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vti1bO88384 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vti1bO88384 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vti1bO88384 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vti1bO88384 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vti1bO88384 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vti1bO88384 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vti1bO88384 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vti1bO88384 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vti1bO88384 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vti1bO88384 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vti1bO88384 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vti1bO88384 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vti1bO88384 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vti1bO88384 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vti1bO88384 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms