Protein–RNA interactions for Protein: O70338

Rnaseh1, Ribonuclease H1, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh1O70338 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnaseh1O70338 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnaseh1O70338 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnaseh1O70338 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnaseh1O70338 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnaseh1O70338 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnaseh1O70338 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnaseh1O70338 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnaseh1O70338 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnaseh1O70338 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnaseh1O70338 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnaseh1O70338 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rnaseh1O70338 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rnaseh1O70338 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnaseh1O70338 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnaseh1O70338 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnaseh1O70338 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnaseh1O70338 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnaseh1O70338 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnaseh1O70338 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnaseh1O70338 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnaseh1O70338 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnaseh1O70338 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnaseh1O70338 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnaseh1O70338 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnaseh1O70338 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnaseh1O70338 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnaseh1O70338 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnaseh1O70338 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnaseh1O70338 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rnaseh1O70338 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnaseh1O70338 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnaseh1O70338 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnaseh1O70338 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnaseh1O70338 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnaseh1O70338 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnaseh1O70338 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnaseh1O70338 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnaseh1O70338 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnaseh1O70338 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnaseh1O70338 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnaseh1O70338 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnaseh1O70338 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnaseh1O70338 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnaseh1O70338 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnaseh1O70338 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnaseh1O70338 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnaseh1O70338 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnaseh1O70338 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnaseh1O70338 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnaseh1O70338 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms