Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top3aO70157 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top3aO70157 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top3aO70157 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top3aO70157 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top3aO70157 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top3aO70157 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Top3aO70157 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top3aO70157 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top3aO70157 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top3aO70157 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top3aO70157 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Top3aO70157 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top3aO70157 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top3aO70157 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top3aO70157 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top3aO70157 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top3aO70157 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top3aO70157 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top3aO70157 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top3aO70157 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Top3aO70157 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top3aO70157 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Top3aO70157 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top3aO70157 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top3aO70157 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top3aO70157 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top3aO70157 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top3aO70157 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top3aO70157 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top3aO70157 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Top3aO70157 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top3aO70157 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top3aO70157 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top3aO70157 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top3aO70157 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top3aO70157 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top3aO70157 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms