Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp2a2O55143 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp2a2O55143 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp2a2O55143 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp2a2O55143 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp2a2O55143 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp2a2O55143 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp2a2O55143 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp2a2O55143 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp2a2O55143 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp2a2O55143 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp2a2O55143 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp2a2O55143 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp2a2O55143 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp2a2O55143 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp2a2O55143 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp2a2O55143 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp2a2O55143 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp2a2O55143 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp2a2O55143 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp2a2O55143 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp2a2O55143 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2a2O55143 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2a2O55143 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2a2O55143 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2a2O55143 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp2a2O55143 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2a2O55143 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2a2O55143 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2a2O55143 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2a2O55143 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2a2O55143 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp2a2O55143 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2a2O55143 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp2a2O55143 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp2a2O55143 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2a2O55143 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp2a2O55143 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atp2a2O55143 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp2a2O55143 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms