Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41,21■■■■■ 4,19
Abcc1O35379 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Abcc1O35379 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,19■■■■■ 4,18
Abcc1O35379 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41,19■■■■■ 4,18
Abcc1O35379 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,18■■■■■ 4,18
Abcc1O35379 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,17■■■■■ 4,18
Abcc1O35379 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41,15■■■■■ 4,18
Abcc1O35379 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,14■■■■■ 4,18
Abcc1O35379 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,14■■■■■ 4,18
Abcc1O35379 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41,13■■■■■ 4,17
Abcc1O35379 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,11■■■■■ 4,17
Abcc1O35379 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,09■■■■■ 4,17
Abcc1O35379 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Abcc1O35379 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41,03■■■■■ 4,16
Abcc1O35379 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41,02■■■■■ 4,16
Abcc1O35379 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
Abcc1O35379 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40,99■■■■■ 4,15
Abcc1O35379 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,96■■■■■ 4,15
Abcc1O35379 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Abcc1O35379 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Abcc1O35379 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40,95■■■■■ 4,15
Abcc1O35379 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,94■■■■■ 4,14
Abcc1O35379 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,94■■■■■ 4,14
Abcc1O35379 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,94■■■■■ 4,14
Abcc1O35379 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40,93■■■■■ 4,14
Abcc1O35379 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40,93■■■■■ 4,14
Abcc1O35379 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Abcc1O35379 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Abcc1O35379 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Abcc1O35379 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Abcc1O35379 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Abcc1O35379 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
Abcc1O35379 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
Abcc1O35379 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
Abcc1O35379 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40,78■■■■■ 4,12
Abcc1O35379 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Abcc1O35379 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Abcc1O35379 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Abcc1O35379 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40,71■■■■■ 4,11
Abcc1O35379 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Abcc1O35379 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Abcc1O35379 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Abcc1O35379 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40,66■■■■■ 4,1
Abcc1O35379 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Abcc1O35379 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Abcc1O35379 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Abcc1O35379 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,62■■■■■ 4,09
Abcc1O35379 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Abcc1O35379 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Abcc1O35379 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Abcc1O35379 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40,57■■■■■ 4,09
Abcc1O35379 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40,57■■■■■ 4,09
Abcc1O35379 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Abcc1O35379 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Abcc1O35379 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,54■■■■■ 4,08
Abcc1O35379 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40,54■■■■■ 4,08
Abcc1O35379 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40,53■■■■■ 4,08
Abcc1O35379 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Abcc1O35379 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Abcc1O35379 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40,52■■■■■ 4,08
Abcc1O35379 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,52■■■■■ 4,08
Abcc1O35379 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Abcc1O35379 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,48■■■■■ 4,07
Abcc1O35379 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,47■■■■■ 4,07
Abcc1O35379 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Abcc1O35379 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Abcc1O35379 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
Abcc1O35379 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Abcc1O35379 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40,44■■■■■ 4,06
Abcc1O35379 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40,44■■■■■ 4,06
Abcc1O35379 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40,43■■■■■ 4,06
Abcc1O35379 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Abcc1O35379 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Abcc1O35379 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40,39■■■■■ 4,06
Abcc1O35379 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40,39■■■■■ 4,06
Abcc1O35379 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Abcc1O35379 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Abcc1O35379 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Abcc1O35379 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Abcc1O35379 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Abcc1O35379 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Abcc1O35379 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,05
Abcc1O35379 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,04
Abcc1O35379 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Abcc1O35379 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Abcc1O35379 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Abcc1O35379 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40,28■■■■■ 4,04
Abcc1O35379 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40,28■■■■■ 4,04
Abcc1O35379 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40,26■■■■■ 4,04
Abcc1O35379 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Abcc1O35379 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Abcc1O35379 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40,26■■■■■ 4,03
Abcc1O35379 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40,25■■■■■ 4,03
Abcc1O35379 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Abcc1O35379 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Abcc1O35379 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Abcc1O35379 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Abcc1O35379 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40,21■■■■■ 4,03
Abcc1O35379 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Abcc1O35379 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms