Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Abcc1O35379 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Abcc1O35379 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Abcc1O35379 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Abcc1O35379 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Abcc1O35379 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Abcc1O35379 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
Abcc1O35379 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc1O35379 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc1O35379 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Abcc1O35379 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Abcc1O35379 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Abcc1O35379 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Abcc1O35379 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Abcc1O35379 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Abcc1O35379 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Abcc1O35379 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Abcc1O35379 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Abcc1O35379 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Abcc1O35379 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Abcc1O35379 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Abcc1O35379 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Abcc1O35379 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Abcc1O35379 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Abcc1O35379 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Abcc1O35379 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Abcc1O35379 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Abcc1O35379 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Abcc1O35379 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Abcc1O35379 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Abcc1O35379 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Abcc1O35379 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Abcc1O35379 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Abcc1O35379 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Abcc1O35379 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Abcc1O35379 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Abcc1O35379 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Abcc1O35379 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Abcc1O35379 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Abcc1O35379 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Abcc1O35379 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Abcc1O35379 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Abcc1O35379 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Abcc1O35379 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Abcc1O35379 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Abcc1O35379 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Abcc1O35379 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Abcc1O35379 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Abcc1O35379 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Abcc1O35379 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Abcc1O35379 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Abcc1O35379 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Abcc1O35379 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Abcc1O35379 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Abcc1O35379 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Abcc1O35379 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Abcc1O35379 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Abcc1O35379 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc1O35379 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc1O35379 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc1O35379 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Abcc1O35379 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Abcc1O35379 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Abcc1O35379 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Abcc1O35379 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Abcc1O35379 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Abcc1O35379 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Abcc1O35379 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Abcc1O35379 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Abcc1O35379 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Abcc1O35379 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Abcc1O35379 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Abcc1O35379 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Abcc1O35379 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Abcc1O35379 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Abcc1O35379 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Abcc1O35379 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Abcc1O35379 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Abcc1O35379 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Abcc1O35379 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Abcc1O35379 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Abcc1O35379 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Abcc1O35379 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Abcc1O35379 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Abcc1O35379 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Abcc1O35379 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Abcc1O35379 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Abcc1O35379 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Abcc1O35379 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Abcc1O35379 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Abcc1O35379 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Abcc1O35379 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
Abcc1O35379 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Abcc1O35379 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Abcc1O35379 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Abcc1O35379 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Abcc1O35379 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Abcc1O35379 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Abcc1O35379 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Abcc1O35379 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms