Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2035J3QP87 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2035J3QP87 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2035J3QP87 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2035J3QP87 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2035J3QP87 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2035J3QP87 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2035J3QP87 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2035J3QP87 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2035J3QP87 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2035J3QP87 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2035J3QP87 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm2035J3QP87 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2035J3QP87 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2035J3QP87 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2035J3QP87 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2035J3QP87 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2035J3QP87 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2035J3QP87 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm2035J3QP87 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2035J3QP87 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2035J3QP87 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2035J3QP87 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2035J3QP87 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2035J3QP87 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2035J3QP87 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2035J3QP87 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2035J3QP87 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2035J3QP87 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2035J3QP87 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2035J3QP87 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2035J3QP87 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2035J3QP87 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2035J3QP87 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2035J3QP87 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2035J3QP87 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2035J3QP87 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2035J3QP87 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2035J3QP87 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2035J3QP87 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2035J3QP87 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2035J3QP87 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2035J3QP87 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2035J3QP87 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2035J3QP87 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2035J3QP87 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2035J3QP87 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2035J3QP87 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2035J3QP87 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2035J3QP87 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2035J3QP87 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2035J3QP87 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2035J3QP87 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2035J3QP87 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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