Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48,63■■■■■ 5,38
BicraF8VPZ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC48,63■■■■■ 5,38
BicraF8VPZ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48,62■■■■■ 5,37
BicraF8VPZ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC48,62■■■■■ 5,37
BicraF8VPZ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48,6■■■■■ 5,37
BicraF8VPZ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48,59■■■■■ 5,37
BicraF8VPZ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,58■■■■■ 5,37
BicraF8VPZ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC48,57■■■■■ 5,37
BicraF8VPZ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC48,56■■■■■ 5,36
BicraF8VPZ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,54■■■■■ 5,36
BicraF8VPZ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,49■■■■■ 5,35
BicraF8VPZ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,42■■■■■ 5,34
BicraF8VPZ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC48,4■■■■■ 5,34
BicraF8VPZ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,38■■■■■ 5,34
BicraF8VPZ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48,38■■■■■ 5,34
BicraF8VPZ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48,34■■■■■ 5,33
BicraF8VPZ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC48,32■■■■■ 5,33
BicraF8VPZ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,31■■■■■ 5,32
BicraF8VPZ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC48,3■■■■■ 5,32
BicraF8VPZ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48,27■■■■■ 5,32
BicraF8VPZ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48,27■■■■■ 5,32
BicraF8VPZ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,26■■■■■ 5,32
BicraF8VPZ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC48,25■■■■■ 5,31
BicraF8VPZ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC48,25■■■■■ 5,31
BicraF8VPZ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48,25■■■■■ 5,31
BicraF8VPZ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC48,2■■■■■ 5,31
BicraF8VPZ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,18■■■■■ 5,3
BicraF8VPZ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC48,17■■■■■ 5,3
BicraF8VPZ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC48,15■■■■■ 5,3
BicraF8VPZ9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,14■■■■■ 5,3
BicraF8VPZ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC48,13■■■■■ 5,29
BicraF8VPZ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC48,13■■■■■ 5,29
BicraF8VPZ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC48,09■■■■■ 5,29
BicraF8VPZ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC48,09■■■■■ 5,29
BicraF8VPZ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC48,08■■■■■ 5,29
BicraF8VPZ9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC48,04■■■■■ 5,28
BicraF8VPZ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,04■■■■■ 5,28
BicraF8VPZ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC48,03■■■■■ 5,28
BicraF8VPZ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC48,03■■■■■ 5,28
BicraF8VPZ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5,28
BicraF8VPZ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC47,97■■■■■ 5,27
BicraF8VPZ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47,97■■■■■ 5,27
BicraF8VPZ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,94■■■■■ 5,27
BicraF8VPZ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC47,92■■■■■ 5,26
BicraF8VPZ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,91■■■■■ 5,26
BicraF8VPZ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,91■■■■■ 5,26
BicraF8VPZ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC47,9■■■■■ 5,26
BicraF8VPZ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC47,86■■■■■ 5,25
BicraF8VPZ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47,86■■■■■ 5,25
BicraF8VPZ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47,86■■■■■ 5,25
BicraF8VPZ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,86■■■■■ 5,25
BicraF8VPZ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,85■■■■■ 5,25
BicraF8VPZ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC47,85■■■■■ 5,25
BicraF8VPZ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,83■■■■■ 5,25
BicraF8VPZ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC47,83■■■■■ 5,25
BicraF8VPZ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC47,83■■■■■ 5,25
BicraF8VPZ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47,81■■■■■ 5,24
BicraF8VPZ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC47,8■■■■■ 5,24
BicraF8VPZ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC47,78■■■■■ 5,24
BicraF8VPZ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47,78■■■■■ 5,24
BicraF8VPZ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC47,77■■■■■ 5,24
BicraF8VPZ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC47,77■■■■■ 5,24
BicraF8VPZ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC47,76■■■■■ 5,24
BicraF8VPZ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC47,73■■■■■ 5,23
BicraF8VPZ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47,73■■■■■ 5,23
BicraF8VPZ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,71■■■■■ 5,23
BicraF8VPZ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC47,68■■■■■ 5,22
BicraF8VPZ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,68■■■■■ 5,22
BicraF8VPZ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47,68■■■■■ 5,22
BicraF8VPZ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC47,66■■■■■ 5,22
BicraF8VPZ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,66■■■■■ 5,22
BicraF8VPZ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC47,66■■■■■ 5,22
BicraF8VPZ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47,65■■■■■ 5,22
BicraF8VPZ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC47,64■■■■■ 5,22
BicraF8VPZ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,64■■■■■ 5,22
BicraF8VPZ9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,64■■■■■ 5,22
BicraF8VPZ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,62■■■■■ 5,21
BicraF8VPZ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC47,62■■■■■ 5,21
BicraF8VPZ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47,59■■■■■ 5,21
BicraF8VPZ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,57■■■■■ 5,21
BicraF8VPZ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,56■■■■■ 5,2
BicraF8VPZ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC47,56■■■■■ 5,2
BicraF8VPZ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC47,54■■■■■ 5,2
BicraF8VPZ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,54■■■■■ 5,2
BicraF8VPZ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC47,54■■■■■ 5,2
BicraF8VPZ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC47,52■■■■■ 5,2
BicraF8VPZ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC47,49■■■■■ 5,19
BicraF8VPZ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,49■■■■■ 5,19
BicraF8VPZ9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,47■■■■■ 5,19
BicraF8VPZ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,47■■■■■ 5,19
BicraF8VPZ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC47,46■■■■■ 5,19
BicraF8VPZ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC47,45■■■■■ 5,19
BicraF8VPZ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC47,44■■■■■ 5,18
BicraF8VPZ9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,43■■■■■ 5,18
BicraF8VPZ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47,43■■■■■ 5,18
BicraF8VPZ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC47,42■■■■■ 5,18
BicraF8VPZ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,41■■■■■ 5,18
BicraF8VPZ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC47,41■■■■■ 5,18
BicraF8VPZ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,38■■■■■ 5,18
BicraF8VPZ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC47,38■■■■■ 5,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,2 ms