Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ythdc1E9Q5K9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ythdc1E9Q5K9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ythdc1E9Q5K9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ythdc1E9Q5K9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ythdc1E9Q5K9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ythdc1E9Q5K9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ythdc1E9Q5K9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ythdc1E9Q5K9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ythdc1E9Q5K9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ythdc1E9Q5K9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ythdc1E9Q5K9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ythdc1E9Q5K9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ythdc1E9Q5K9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ythdc1E9Q5K9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ythdc1E9Q5K9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ythdc1E9Q5K9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Ythdc1E9Q5K9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ythdc1E9Q5K9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Ythdc1E9Q5K9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ythdc1E9Q5K9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ythdc1E9Q5K9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ythdc1E9Q5K9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ythdc1E9Q5K9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ythdc1E9Q5K9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ythdc1E9Q5K9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ythdc1E9Q5K9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ythdc1E9Q5K9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ythdc1E9Q5K9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ythdc1E9Q5K9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ythdc1E9Q5K9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ythdc1E9Q5K9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ythdc1E9Q5K9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ythdc1E9Q5K9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ythdc1E9Q5K9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ythdc1E9Q5K9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc1E9Q5K9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Ythdc1E9Q5K9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ythdc1E9Q5K9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ythdc1E9Q5K9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc1E9Q5K9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc1E9Q5K9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ythdc1E9Q5K9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ythdc1E9Q5K9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ythdc1E9Q5K9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ythdc1E9Q5K9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ythdc1E9Q5K9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ythdc1E9Q5K9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ythdc1E9Q5K9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ythdc1E9Q5K9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ythdc1E9Q5K9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ythdc1E9Q5K9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ythdc1E9Q5K9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ythdc1E9Q5K9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms