Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3020E9Q3J7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3020E9Q3J7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3020E9Q3J7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3020E9Q3J7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3020E9Q3J7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3020E9Q3J7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3020E9Q3J7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm3020E9Q3J7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3020E9Q3J7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3020E9Q3J7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3020E9Q3J7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3020E9Q3J7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3020E9Q3J7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3020E9Q3J7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3020E9Q3J7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3020E9Q3J7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3020E9Q3J7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3020E9Q3J7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3020E9Q3J7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3020E9Q3J7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3020E9Q3J7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3020E9Q3J7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3020E9Q3J7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3020E9Q3J7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3020E9Q3J7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3020E9Q3J7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms