Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Ift140E9PY46 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Ift140E9PY46 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Ift140E9PY46 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Ift140E9PY46 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Ift140E9PY46 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Ift140E9PY46 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Ift140E9PY46 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Ift140E9PY46 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Ift140E9PY46 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Ift140E9PY46 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
Ift140E9PY46 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Ift140E9PY46 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Ift140E9PY46 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Ift140E9PY46 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Ift140E9PY46 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Ift140E9PY46 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Ift140E9PY46 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
Ift140E9PY46 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Ift140E9PY46 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Ift140E9PY46 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Ift140E9PY46 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Ift140E9PY46 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Ift140E9PY46 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
Ift140E9PY46 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Ift140E9PY46 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Ift140E9PY46 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Ift140E9PY46 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Ift140E9PY46 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Ift140E9PY46 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Ift140E9PY46 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Ift140E9PY46 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Ift140E9PY46 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Ift140E9PY46 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Ift140E9PY46 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Ift140E9PY46 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Ift140E9PY46 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.32
Ift140E9PY46 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ift140E9PY46 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ift140E9PY46 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ift140E9PY46 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Ift140E9PY46 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Ift140E9PY46 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Ift140E9PY46 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Ift140E9PY46 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Ift140E9PY46 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Ift140E9PY46 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Ift140E9PY46 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Ift140E9PY46 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Ift140E9PY46 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Ift140E9PY46 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Ift140E9PY46 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
Ift140E9PY46 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Ift140E9PY46 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ift140E9PY46 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Ift140E9PY46 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Ift140E9PY46 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Ift140E9PY46 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Ift140E9PY46 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Ift140E9PY46 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Ift140E9PY46 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Ift140E9PY46 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Ift140E9PY46 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Ift140E9PY46 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Ift140E9PY46 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Ift140E9PY46 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ift140E9PY46 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ift140E9PY46 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ift140E9PY46 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ift140E9PY46 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ift140E9PY46 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ift140E9PY46 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ift140E9PY46 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ift140E9PY46 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
Ift140E9PY46 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
Ift140E9PY46 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Ift140E9PY46 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
Ift140E9PY46 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ift140E9PY46 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Ift140E9PY46 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ift140E9PY46 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ift140E9PY46 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ift140E9PY46 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Ift140E9PY46 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Ift140E9PY46 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Ift140E9PY46 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Ift140E9PY46 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Ift140E9PY46 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
Ift140E9PY46 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ift140E9PY46 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Ift140E9PY46 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ift140E9PY46 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
Ift140E9PY46 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Ift140E9PY46 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Ift140E9PY46 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ift140E9PY46 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Ift140E9PY46 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Ift140E9PY46 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Ift140E9PY46 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Ift140E9PY46 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms