Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
9630041A04RikD3Z3U4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
9630041A04RikD3Z3U4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
9630041A04RikD3Z3U4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
9630041A04RikD3Z3U4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
9630041A04RikD3Z3U4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
9630041A04RikD3Z3U4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
9630041A04RikD3Z3U4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
9630041A04RikD3Z3U4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
9630041A04RikD3Z3U4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
9630041A04RikD3Z3U4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
9630041A04RikD3Z3U4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
9630041A04RikD3Z3U4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
9630041A04RikD3Z3U4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
9630041A04RikD3Z3U4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
9630041A04RikD3Z3U4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
9630041A04RikD3Z3U4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
9630041A04RikD3Z3U4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
9630041A04RikD3Z3U4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
9630041A04RikD3Z3U4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
9630041A04RikD3Z3U4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
9630041A04RikD3Z3U4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
9630041A04RikD3Z3U4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
9630041A04RikD3Z3U4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
9630041A04RikD3Z3U4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
9630041A04RikD3Z3U4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
9630041A04RikD3Z3U4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
9630041A04RikD3Z3U4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
9630041A04RikD3Z3U4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
9630041A04RikD3Z3U4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
9630041A04RikD3Z3U4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
9630041A04RikD3Z3U4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
9630041A04RikD3Z3U4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
9630041A04RikD3Z3U4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
9630041A04RikD3Z3U4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
9630041A04RikD3Z3U4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
9630041A04RikD3Z3U4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
9630041A04RikD3Z3U4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
9630041A04RikD3Z3U4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
9630041A04RikD3Z3U4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
9630041A04RikD3Z3U4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
9630041A04RikD3Z3U4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
9630041A04RikD3Z3U4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
9630041A04RikD3Z3U4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
9630041A04RikD3Z3U4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
9630041A04RikD3Z3U4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
9630041A04RikD3Z3U4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
9630041A04RikD3Z3U4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
9630041A04RikD3Z3U4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
9630041A04RikD3Z3U4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
9630041A04RikD3Z3U4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
9630041A04RikD3Z3U4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
9630041A04RikD3Z3U4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
9630041A04RikD3Z3U4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
9630041A04RikD3Z3U4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
9630041A04RikD3Z3U4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
9630041A04RikD3Z3U4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
9630041A04RikD3Z3U4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
9630041A04RikD3Z3U4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
9630041A04RikD3Z3U4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
9630041A04RikD3Z3U4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms