Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3676D3Z236 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3676D3Z236 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3676D3Z236 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3676D3Z236 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3676D3Z236 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3676D3Z236 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3676D3Z236 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3676D3Z236 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3676D3Z236 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3676D3Z236 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3676D3Z236 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3676D3Z236 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3676D3Z236 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3676D3Z236 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3676D3Z236 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3676D3Z236 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3676D3Z236 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3676D3Z236 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3676D3Z236 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3676D3Z236 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3676D3Z236 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3676D3Z236 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3676D3Z236 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3676D3Z236 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3676D3Z236 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3676D3Z236 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3676D3Z236 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3676D3Z236 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3676D3Z236 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3676D3Z236 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3676D3Z236 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3676D3Z236 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3676D3Z236 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3676D3Z236 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3676D3Z236 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3676D3Z236 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3676D3Z236 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3676D3Z236 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3676D3Z236 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3676D3Z236 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3676D3Z236 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3676D3Z236 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3676D3Z236 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3676D3Z236 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3676D3Z236 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3676D3Z236 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms