Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms