Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptprz1B9EKR1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptprz1B9EKR1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptprz1B9EKR1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptprz1B9EKR1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptprz1B9EKR1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptprz1B9EKR1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptprz1B9EKR1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptprz1B9EKR1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptprz1B9EKR1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptprz1B9EKR1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptprz1B9EKR1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ptprz1B9EKR1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptprz1B9EKR1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptprz1B9EKR1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptprz1B9EKR1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptprz1B9EKR1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptprz1B9EKR1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptprz1B9EKR1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptprz1B9EKR1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptprz1B9EKR1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptprz1B9EKR1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptprz1B9EKR1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptprz1B9EKR1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptprz1B9EKR1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptprz1B9EKR1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptprz1B9EKR1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptprz1B9EKR1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptprz1B9EKR1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptprz1B9EKR1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptprz1B9EKR1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptprz1B9EKR1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptprz1B9EKR1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptprz1B9EKR1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptprz1B9EKR1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptprz1B9EKR1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptprz1B9EKR1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptprz1B9EKR1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptprz1B9EKR1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptprz1B9EKR1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptprz1B9EKR1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprz1B9EKR1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptprz1B9EKR1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptprz1B9EKR1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptprz1B9EKR1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptprz1B9EKR1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms