Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Ythdc2B2RR83 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ythdc2B2RR83 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ythdc2B2RR83 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
Ythdc2B2RR83 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ythdc2B2RR83 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
Ythdc2B2RR83 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Ythdc2B2RR83 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Ythdc2B2RR83 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Ythdc2B2RR83 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Ythdc2B2RR83 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Ythdc2B2RR83 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Ythdc2B2RR83 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Ythdc2B2RR83 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Ythdc2B2RR83 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Ythdc2B2RR83 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Ythdc2B2RR83 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Ythdc2B2RR83 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Ythdc2B2RR83 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Ythdc2B2RR83 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Ythdc2B2RR83 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Ythdc2B2RR83 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Ythdc2B2RR83 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Ythdc2B2RR83 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ythdc2B2RR83 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Ythdc2B2RR83 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Ythdc2B2RR83 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Ythdc2B2RR83 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Ythdc2B2RR83 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Ythdc2B2RR83 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Ythdc2B2RR83 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Ythdc2B2RR83 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Ythdc2B2RR83 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Ythdc2B2RR83 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Ythdc2B2RR83 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ythdc2B2RR83 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ythdc2B2RR83 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
Ythdc2B2RR83 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Ythdc2B2RR83 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Ythdc2B2RR83 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Ythdc2B2RR83 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
Ythdc2B2RR83 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Ythdc2B2RR83 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Ythdc2B2RR83 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
Ythdc2B2RR83 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Ythdc2B2RR83 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Ythdc2B2RR83 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Ythdc2B2RR83 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Ythdc2B2RR83 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Ythdc2B2RR83 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Ythdc2B2RR83 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Ythdc2B2RR83 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ythdc2B2RR83 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ythdc2B2RR83 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ythdc2B2RR83 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ythdc2B2RR83 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ythdc2B2RR83 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ythdc2B2RR83 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Ythdc2B2RR83 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Ythdc2B2RR83 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ythdc2B2RR83 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ythdc2B2RR83 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Ythdc2B2RR83 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Ythdc2B2RR83 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ythdc2B2RR83 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ythdc2B2RR83 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Ythdc2B2RR83 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Ythdc2B2RR83 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ythdc2B2RR83 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ythdc2B2RR83 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ythdc2B2RR83 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ythdc2B2RR83 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Ythdc2B2RR83 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ythdc2B2RR83 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ythdc2B2RR83 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ythdc2B2RR83 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.03
Ythdc2B2RR83 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ythdc2B2RR83 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
Ythdc2B2RR83 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ythdc2B2RR83 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Ythdc2B2RR83 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ythdc2B2RR83 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Ythdc2B2RR83 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Ythdc2B2RR83 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Ythdc2B2RR83 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Ythdc2B2RR83 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Ythdc2B2RR83 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
Ythdc2B2RR83 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Ythdc2B2RR83 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Ythdc2B2RR83 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
Ythdc2B2RR83 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ythdc2B2RR83 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ythdc2B2RR83 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ythdc2B2RR83 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ythdc2B2RR83 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ythdc2B2RR83 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Ythdc2B2RR83 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Ythdc2B2RR83 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Ythdc2B2RR83 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Ythdc2B2RR83 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms