Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf25B1AWN9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf25B1AWN9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf25B1AWN9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf25B1AWN9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf25B1AWN9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf25B1AWN9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf25B1AWN9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf25B1AWN9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf25B1AWN9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf25B1AWN9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf25B1AWN9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf25B1AWN9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf25B1AWN9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf25B1AWN9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf25B1AWN9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf25B1AWN9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf25B1AWN9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf25B1AWN9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf25B1AWN9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfrsf25B1AWN9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf25B1AWN9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf25B1AWN9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf25B1AWN9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf25B1AWN9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf25B1AWN9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf25B1AWN9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf25B1AWN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf25B1AWN9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf25B1AWN9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnfrsf25B1AWN9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnfrsf25B1AWN9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfrsf25B1AWN9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf25B1AWN9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfrsf25B1AWN9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf25B1AWN9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf25B1AWN9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfrsf25B1AWN9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf25B1AWN9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf25B1AWN9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfrsf25B1AWN9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfrsf25B1AWN9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf25B1AWN9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf25B1AWN9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf25B1AWN9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfrsf25B1AWN9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfrsf25B1AWN9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf25B1AWN9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms