Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r232A2RTT5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r232A2RTT5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r232A2RTT5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r232A2RTT5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r232A2RTT5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmn1r232A2RTT5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r232A2RTT5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r232A2RTT5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r232A2RTT5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r232A2RTT5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r232A2RTT5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r232A2RTT5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms