Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP16Q9Y5T5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP16Q9Y5T5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP16Q9Y5T5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms