Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KNSTRNQ9Y448 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNSTRNQ9Y448 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms